Une sécheresse massive qui a duré des siècles pourrait avoir entraîné l’extinction des « hobbits » de Flores. Les enregistrements climatiques conservés dans les formations souterraines montrent que les précipitations ont chuté au moment même où la petite espèce humaine disparaissait. Dans le même temps, le nombre d’éléphants pygmées dont ils dépendaient a fortement diminué à mesure que les rivières s’asséchaient. Avec la disparition de la nourriture et de l'eau, les hobbits ont peut-être été repoussés et entrés dans leur dernier chapitre.
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